瓊脂糖凝膠回收DNA片段的核心原則
選擇性分離?:通過(guò)電泳分離目標(biāo)DNA條帶后,需精確切取含目的片段的凝膠區(qū)域,避免污染或損失?。
高效吸附與洗脫?:利用硅基質(zhì)膜或離心柱特異性結(jié)合DNA,通過(guò)緩沖液梯度洗脫實(shí)現(xiàn)純化?。
最小化損傷?:紫外照射時(shí)間需嚴(yán)格控制(<30秒),推薦使用藍(lán)光切膠儀減少DNA斷裂風(fēng)險(xiǎn)?。
關(guān)鍵操作步驟與注意事項(xiàng)
1. ?電泳與切膠?
凝膠濃度選擇?:
大片段(>1kb)用0.5%-1%瓊脂糖,小片段(<500bp)用1.5%-2%?。
切膠要點(diǎn)?:
快速切割目標(biāo)條帶,膠塊體積≤0.3g,避免紫外過(guò)度暴露?。
刀片需滅菌,防止外源DNA污染?。
2. ?溶膠與吸附?
溶膠條件?:
55-65℃水浴溶解,每3分鐘震蕩混勻,確保瓊脂糖融化(溶液呈淡黃色)?。
膠塊過(guò)大時(shí)需分次處理或增加溶膠液體積?。
離心柱操作?:
溶膠液轉(zhuǎn)移時(shí)避免觸碰濾膜,離心后檢查收集管液體顏色(黃色提示溶膠過(guò)量)?。
3. ?洗脫與純化?
洗脫優(yōu)化?:
洗脫液預(yù)熱至65℃,體積30-50μl,垂直滴加至膜中央?。
洗脫前空離2分鐘去除殘留乙醇,避免抑制后續(xù)酶反應(yīng)?。
質(zhì)量驗(yàn)證?:
通過(guò)A260/A280(1.8-2.0)和A260/A230(>1.8)評(píng)估純度?。
常見(jiàn)問(wèn)題與解決方案
回收率低?:
可能原因:膠塊未溶解、緩沖液pH異常、洗脫液未預(yù)熱?。
解決:延長(zhǎng)溶膠時(shí)間、調(diào)整pH至8.0-8.5、增加洗脫液靜置時(shí)間?。
產(chǎn)物污染?:
可能原因:膠塊殘留多糖、乙醇未揮發(fā)干凈?。
解決:二次純化或使用糖原輔助小片段回收?。
安全與設(shè)備維護(hù)
防護(hù)措施?:
操作EB染料時(shí)需戴手套,廢棄物單獨(dú)存放于橙色容器?。
設(shè)備清潔?:
電泳槽每月用0.1M HCl浸泡,紫外燈管每200小時(shí)更換?。
注:以上僅供參考,科研使用,不作為實(shí)際數(shù)據(jù),實(shí)驗(yàn)需嚴(yán)格遵循說(shuō)明或咨詢技術(shù)老師。
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